<Complete RNA series

GAPDH mRNA, Rat 

RNA の 5' 末端に cap 構造を、3' 末端に Poly (A) tail を付加した均質なラット mRNA 標品~

Code No.
製品名
包装単位
希望納入価格
310-06851 GAPDH mRNA, Rat
10µl (10ng/µl)
32,000円

 本品は、ラット glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 遺伝子の全長配列を有する RNA の 5'末端に cap 構造を、3' 末端に Poly (A) tail を付加した均質なラット mRNA 標品です。
Real-Time PCR 実験の絶対量コントロールや、バリデーションコントロールを取るためのテンプレートとして用いることが可能です。

・5' 末端に cap 構造を、3' 末端に Poly (A) tail を持ちます。
・単一な遺伝子配列をもつ RNA です。
・世界初の生体内の mRNA を再現した単一の RNA 分子です。
・各種遺伝子発現解析の実験プロトコールの標準化をサポートします。

*リアルタイム定量 RT-PCR のバリデーションコントロールに!
*リアルタイム定量 RT-PCR の絶対量コントロールに!

リアルタイム定量 PCR

本製品( 108 copy ~ 103 copy 相当量 ) を 遺伝子特異的なプライマーとプローブを用いて 2step リアルタイム定量 PCR を行い、 Standard Curve を作成した 。

反応試薬: qPCR Mastermix Plus Low ROX
       (EUROGENTEC 社製品, 312-80431)
使用機器: ABI PRISM® 7500 Fast
反応条件: Detection : 蛍光標識プローブ
       Reaction Volume : 20 µl
       standard 7500 mode
(プライマー,プローブ配列は下記に記載)

Cycle Program 95°C 10 min
95°C 15 sec ×40 Cycles
60°C 1 min
   

Standard Curve

Slope
Intercept
R2
-3.49321
41.05019

0.99981

⇒ R2> 0.99 となり高い定量性を示した。

 

実験データ1で使用したプライマーおよびプローブ配列
 
配列
Forward Primer 5'-TGG CCT CCA AGG AGT AAG AAA C -3'
Reverse Primer 5'-GGC CTC TCT CTT GCT CTC AGT ATC-3'
Double-Dye Probe 5'FAM-CTG GAC CAC CCA GCC CAG CAA-3'TAMRA

*プライマー,プローブは ニッポン イージーティー にて合成したものを使用しております。
本Primer-Probe配列は、Complete RNAの検量線作成の実験のみに用いるため設計しました。そのため、残存ゲノムDNAを検出しないような領域に設計する考慮はしておりませんので、ご注意ください。

純度: 変性アガロースゲル電気泳動

本製品を、変性アガロースゲルにて電気泳動を行い、純度を確認した。

 1 2

M: RNA Ladder(0.125 - 6.0 k base) 1µl
1: 本製品 100 ng

2% Agarose S (ホルムアルデヒド変性ゲル)EtBr染色
100V 30min 電気泳動

本製品の配列は、Cap Site cDNA dT Rat Liver を鋳型とした PCR 産物に由来してお ります。
下記のリンクをクリックすると、塩基配列情報 (テキストファイル) をダウンロードで きます。

GAPDH mRNA, Rat

[備考] 本製品の塩基配列は、〈GenBank〉Accession No,NM_017008 (Version, NM_017008.3) の配列と以下の4箇所が異なります。

1 ・ 6塩基目の 「u」 の後ろに、NM_017008 では 「g」 が存在する。
2 ・ 7 塩基目の 「a」 は、 NM_017008では 「g」 である。
3 ・ 5'側の6塩基および3'側の11塩基は製造上の理由で付加されています。
4 ・ 1283塩基目から約50merの「a」が付加されています。

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