バンド移動距離に対するAgarose濃度の影響

Agarose S 0.5% gel、1% gel、2% gelを用いて分子量マーカーを泳動し、バンド移動距離に対するAgarose濃度の影響を調べました。
ゲル作成の際の濃度決定のご参考になれば幸いです。

使用した試薬と方法

Agarose gel

Agarose S 0.5% gel

Agarose S 1% gel

Agarose S 2% gel

Buffer
TAE Buffer

電気泳動サンプル

下記サンプルを各5µlを泳動

OneSTEP Ladder 1kb (Ladder : 1-10kbp)

OneSTEP Ladder 500 (Ladder : 0.5-5kbp)

OneSTEP Ladder 100 (Ladder : 0.1-2kbp)

Smart Ladder (Ladder : 0.2-10kbp)

OneSTEP Marker 1 (λ/Hind III digest : 0.13-23.13kbp)

OneSTEP Marker 6 (λ/Sty I digest : 0.07-19.33kbp)

OneSTEP Marker 4 (φX174/Hae III digest : 72-1353bp)

OneSTEP Marker 5 (φX174/Hinc II digest : 79-1057bp)

電気泳動条件

電圧 : 100V

泳動時間 : BPBがゲルの2/3に達するまで泳動

結果

Agarose S 　0.5% gel

Agarose S 　1% gel

Agarose S　 2% gel

Lane 1 : OneSTEP Ladder 1kb

Lane 2 : OneSTEP Ladder 500

Lane 3 : OneSTEP Ladder 100

Lane 4 : Smart Ladder

Lane 5 : OneSTEP Marker 1

Lane 6 : OneSTEP Marker 6

Lane 7 : OneSTEP Marker 4

Lane 8 : OneSTEP Marker 5　　　　　　　　　(Lane番号は左側から順に1,2,3,…)

Agarose gel	Agarose S 0.5% gel Agarose S 1% gel Agarose S 2% gel
Buffer	TAE Buffer
電気泳動サンプル	下記サンプルを各5µlを泳動 OneSTEP Ladder 1kb (Ladder : 1-10kbp) OneSTEP Ladder 500 (Ladder : 0.5-5kbp) OneSTEP Ladder 100 (Ladder : 0.1-2kbp) Smart Ladder (Ladder : 0.2-10kbp) OneSTEP Marker 1 (λ/Hind III digest : 0.13-23.13kbp) OneSTEP Marker 6 (λ/Sty I digest : 0.07-19.33kbp) OneSTEP Marker 4 (φX174/Hae III digest : 72-1353bp) OneSTEP Marker 5 (φX174/Hinc II digest : 79-1057bp)
電気泳動条件	電圧 : 100V 泳動時間 : BPBがゲルの2/3に達するまで泳動

Agarose S 　0.5% gel	Agarose S 　1% gel	Agarose S　 2% gel

Lane 1 : OneSTEP Ladder 1kb Lane 2 : OneSTEP Ladder 500 Lane 3 : OneSTEP Ladder 100 Lane 4 : Smart Ladder Lane 5 : OneSTEP Marker 1 Lane 6 : OneSTEP Marker 6 Lane 7 : OneSTEP Marker 4 Lane 8 : OneSTEP Marker 5　　　　　　　　　(Lane番号は左側から順に1,2,3,…)